Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MS4A3Q96HJ5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms