Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RRP36Q96EU6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRP36Q96EU6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms