Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHMP4CQ96CF2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHMP4CQ96CF2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms