Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLUAP1Q96AJ1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLUAP1Q96AJ1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms