Protein–RNA interactions for Protein: Q969M2

GJA10, Gap junction alpha-10 protein, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA10Q969M2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA10Q969M2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA10Q969M2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA10Q969M2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA10Q969M2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA10Q969M2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA10Q969M2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA10Q969M2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms