Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCAF4Q8WV16 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms