Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HELQQ8TDG4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HELQQ8TDG4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms