Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CARMIL3Q8ND23 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL3Q8ND23 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms