Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PNLDC1Q8NA58 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms