Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC155Q8N6L0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms