Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LTBP4Q8N2S1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LTBP4Q8N2S1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms