Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX90

SKA3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA3Q8IX90 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKA3Q8IX90 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKA3Q8IX90 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms