Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPBP1Q86WP2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPBP1Q86WP2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms