Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD4Q7Z3J3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD4Q7Z3J3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms