Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LRRC9Q6ZRR7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
LRRC9Q6ZRR7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRC9Q6ZRR7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRC9Q6ZRR7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRC9Q6ZRR7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRC9Q6ZRR7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRC9Q6ZRR7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRC9Q6ZRR7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRC9Q6ZRR7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LRRC9Q6ZRR7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms