Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSTM1Q6UX27 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms