Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
TMCO3Q6UWJ1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMCO3Q6UWJ1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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