Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OPN5Q6U736 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms