Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOA5Q6Q788 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA5Q6Q788 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms