Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q546

HUB1, Ubiquitin-like modifier HUB1, yeast

Predictions only

Length 73 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HUB1	Q6Q546	ECM9	YKR004C	1134 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
HUB1	Q6Q546	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
HUB1	Q6Q546	PTP2	YOR208W	2253 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	HAL9	YOL089C	3093 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	YCR022C	YCR022C	345 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	YPL205C	YPL205C	345 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	NUP82	YJL061W	2142 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	PRP21	YJL203W	843 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	YPR160W-A	YPR160W-A	81 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	UTP8	YGR128C	2142 nt		-1	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	RFX1	YLR176C	2436 nt		-1	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	GPG1	YGL121C	381 nt		-1	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	SMD2	YLR275W	333 nt		-1	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	NIP1	YMR309C	2439 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	ERV15	YBR210W	429 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	NPC2	YDL046W	522 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	YOR345C	YOR345C	351 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	NNF2	YGR089W	2811 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	MCM10	YIL150C	1716 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	YDL152W	YDL152W	366 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	YER038W-A	YER038W-A	381 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	YGR204C-A	YGR204C-A	114 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	ARV1	YLR242C	966 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	snR33	snR33	183 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
HUB1	Q6Q546	MMS21	YEL019C	804 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
HUB1	Q6Q546	YAL067W-A	YAL067W-A	228 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
HUB1	Q6Q546	YFR012W-A	YFR012W-A	87 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
HUB1	Q6Q546	YDL068W	YDL068W	330 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
HUB1	Q6Q546	HTB1	YDR224C	396 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
HUB1	Q6Q546	BI3	Q0115	1554 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
HUB1	Q6Q546	AFB1	YLR040C	675 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
HUB1	Q6Q546	YLL032C	YLL032C	2478 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
HUB1	Q6Q546	YPR096C	YPR096C	303 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
HUB1	Q6Q546	YJR141W	YJR141W	1044 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	YLR198C	YLR198C	360 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	YMR158C-A	YMR158C-A	138 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	YBR064W	YBR064W	429 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	YNL162W-A	YNL162W-A	219 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	YDR008C	YDR008C	351 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	RPL29	YFR032C-A	180 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	YGL204C	YGL204C	306 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	YJR079W	YJR079W	330 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	YMR153C-A	YMR153C-A	336 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	TFB6	YOR352W	1032 nt		-1.13	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	MRPL31	YKL138C	396 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	YLR399W-A	YLR399W-A	105 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	YPL119C-A	YPL119C-A	264 nt		-1.14	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	YPL185W	YPL185W	396 nt		-1.15	□□□□□ -2.59
HUB1	Q6Q546	YGL042C	YGL042C	306 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	YNL067W-B	YNL067W-B	141 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	YBR206W	YBR206W	324 nt		-1.16	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	GSP1	YLR293C	660 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	YMR075C-A	YMR075C-A	366 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	YBR121C-A	YBR121C-A	159 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	snR36	snR36	182 nt		-1.17	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	RUB1	YDR139C	234 nt		-1.18	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	PET20	YPL159C	762 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	BI4	Q0120	1917 nt		-1.19	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	PAN3	YKL025C	2040 nt		-1.2	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	YER076W-A	YER076W-A	348 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	snR44	snR44	211 nt		-1.21	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	15S_rRNA	15S_rRNA	1649 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	ATP20	YPR020W	348 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	snR24	snR24	89 nt		-1.22	□□□□□ -2.6
HUB1	Q6Q546	QCR7	YDR529C	384 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	TDA2	YER071C	381 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	YHR131W-A	YHR131W-A	246 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	YPR099C	YPR099C	357 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	GLG1	YKR058W	1851 nt		-1.23	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	snR79	snR79	84 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	ATC1	YDR184C	885 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	YNL319W	YNL319W	441 nt		-1.24	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	ZIP2	YGL249W	2115 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	SEM1	YDR363W-A	270 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	tN(GUU)Q	tN(GUU)Q	71 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	PFS1	YHR185C	714 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	SNU56	YDR240C	1479 nt		-1.25	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	YER138W-A	YER138W-A	105 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	YGR115C	YGR115C	780 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	YJL120W	YJL120W	324 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	IPP1	YBR011C	864 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	YPR142C	YPR142C	564 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	UBS1	YBR165W	834 nt		-1.26	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	YCR024C-B	YCR024C-B	267 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	PAA1	YDR071C	576 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	TIM13	YGR181W	318 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	PSF2	YJL072C	642 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	MFA2	YNL145W	117 nt		-1.27	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	MRPS8	YMR158W	468 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	YOR248W	YOR248W	303 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-1.28	□□□□□ -2.61
HUB1	Q6Q546	IRC2	YDR112W	309 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	ECL1	YGR146C	636 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	YJL135W	YJL135W	318 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	YLR271W	YLR271W	825 nt		-1.29	□□□□□ -2.62
HUB1	Q6Q546	COG6	YNL041C	2520 nt		-1.3	□□□□□ -2.62

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