Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF7Q6Q0C0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAF7Q6Q0C0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms