Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFCAB12Q6NXP0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms