Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VIRMAQ69YN4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VIRMAQ69YN4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms