Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LHX8Q68G74 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LHX8Q68G74 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms