Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PXDC1Q5TGL8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms