Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CRB2Q5IJ48 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CRB2Q5IJ48 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms