Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CEP55Q53EZ4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP55Q53EZ4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms