Protein–RNA interactions for Protein: Q3E827

LSO1, Protein LSO1, yeastyeast

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSO1Q3E827 TRL1YJL087C 2484 nt2.69□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 PTP2YOR208W 2253 nt2.69□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 KTI11YBL071W-A 249 nt2.69□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 TUS1YLR425W 3924 nt2.69□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 NUM1YDR150W 8247 nt2.68□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 MLH3YPL164C 2148 nt2.68□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 RPS17AYML024W 411 nt2.68□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 YEF3YLR249W 3135 nt2.68□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 YDR341CYDR341C 1824 nt2.68□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 AHC1YOR023C 1701 nt2.68□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 TOR1YJR066W 7413 nt2.68□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 NMD2YHR077C 3270 nt2.67□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 CDC60YPL160W 3273 nt2.67□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 PAU10YDR542W 363 nt2.67□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 PAU11YGL261C 363 nt2.67□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 PAU4YLR461W 363 nt2.67□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 GIP3YPL137C 3831 nt2.67□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 PHO91YNR013C 2685 nt2.66□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 HAL9YOL089C 3093 nt2.66□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 SBE22YHR103W 2559 nt2.65□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 ATG11YPR049C 3537 nt2.65□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 SLD3YGL113W 2007 nt2.65□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 MSH5YDL154W 2706 nt2.65□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 RAV1YJR033C 4074 nt2.64□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 PET309YLR067C 2898 nt2.64□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 YLR012CYLR012C 300 nt2.64□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.64□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 RPL33AYPL143W 324 nt2.64□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 HMI1YOL095C 2121 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 BUD2YKL092C 3315 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 KRE33YNL132W 3171 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 PIG1YLR273C 1947 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 SYH1YPL105C 2550 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 CHC1YGL206C 4962 nt2.63□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 BNR1YIL159W 4128 nt2.62□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.62□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 MSB2YGR014W 3921 nt2.62□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 PSD2YGR170W 3417 nt2.62□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 APL5YPL195W 2799 nt2.61□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 CTR9YOL145C 3234 nt2.61□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.61□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 MLH1YMR167W 2310 nt2.61□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 AGC1YPR021C 2709 nt2.61□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 TCB2YNL087W 3537 nt2.6□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 PBY1YBR094W 2262 nt2.6□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.6□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.6□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.59□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 RPL37BYDR500C 267 nt2.59□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 YOR102WYOR102W 351 nt2.59□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 YBR178WYBR178W 375 nt2.59□□□□□ -1.99
LSO1Q3E827 IRE1YHR079C 3348 nt2.59□□□□□ -2
LSO1Q3E827 SAP190YKR028W 3102 nt2.59□□□□□ -2
LSO1Q3E827 YIL174WYIL174W 228 nt2.58□□□□□ -2
LSO1Q3E827 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.58□□□□□ -2
LSO1Q3E827 ESL2YKR096W 3588 nt2.58□□□□□ -2
LSO1Q3E827 ALK1YGL021W 2283 nt2.58□□□□□ -2
LSO1Q3E827 IRA2YOL081W 9240 nt2.58□□□□□ -2
LSO1Q3E827 UBP1YDL122W 2430 nt2.58□□□□□ -2
LSO1Q3E827 RTT107YHR154W 3213 nt2.57□□□□□ -2
LSO1Q3E827 SKP2YNL311C 2292 nt2.57□□□□□ -2
LSO1Q3E827 RSE1YML049C 4086 nt2.56□□□□□ -2
LSO1Q3E827 YDR521WYDR521W 336 nt2.55□□□□□ -2
LSO1Q3E827 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt2.55□□□□□ -2
LSO1Q3E827 TIM9YEL020W-A 264 nt2.55□□□□□ -2
LSO1Q3E827 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt2.55□□□□□ -2
LSO1Q3E827 RTT101YJL047C 2529 nt2.54□□□□□ -2
LSO1Q3E827 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt2.54□□□□□ -2
LSO1Q3E827 YPL044CYPL044C 549 nt2.54□□□□□ -2
LSO1Q3E827 PKH2YOL100W 3246 nt2.54□□□□□ -2
LSO1Q3E827 SPF1YEL031W 3648 nt2.54□□□□□ -2
LSO1Q3E827 NEW1YPL226W 3591 nt2.54□□□□□ -2
LSO1Q3E827 IFH1YLR223C 3258 nt2.53□□□□□ -2
LSO1Q3E827 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.53□□□□□ -2
LSO1Q3E827 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.53□□□□□ -2
LSO1Q3E827 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.53□□□□□ -2
LSO1Q3E827 FRK1YPL141C 2598 nt2.53□□□□□ -2.01
LSO1Q3E827 YJL022WYJL022W 309 nt2.52□□□□□ -2.01
LSO1Q3E827 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.52□□□□□ -2.01
LSO1Q3E827 RPS30BYOR182C 192 nt2.52□□□□□ -2.01
LSO1Q3E827 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt2.52□□□□□ -2.01
LSO1Q3E827 TOF1YNL273W 3717 nt2.52□□□□□ -2.01
LSO1Q3E827 BCK1YJL095W 4437 nt2.52□□□□□ -2.01
LSO1Q3E827 COG4YPR105C 2586 nt2.51□□□□□ -2.01
LSO1Q3E827 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.51□□□□□ -2.01
LSO1Q3E827 SLI15YBR156C 2097 nt2.51□□□□□ -2.01
LSO1Q3E827 AXL1YPR122W 3627 nt2.49□□□□□ -2.01
LSO1Q3E827 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.49□□□□□ -2.01
LSO1Q3E827 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.49□□□□□ -2.01
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