Protein–RNA interactions for Protein: Q3E7B7

YDL085C-A, SERF-like protein YDL085C-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL085C-AQ3E7B7 ZIP2YGL249W 2115 nt0.35□□□□□ -2.35
YDL085C-AQ3E7B7 NOP9YJL010C 2001 nt0.35□□□□□ -2.35
YDL085C-AQ3E7B7 RPL9AYGL147C 576 nt0.34□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.34□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 NPR2YEL062W 1848 nt0.34□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 VMA21YGR105W 234 nt0.33□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.33□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 ABF2YMR072W 552 nt0.33□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.33□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 YOR282WYOR282W 321 nt0.33□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 YDR344CYDR344C 444 nt0.32□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 GPG1YGL121C 381 nt0.32□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.32□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt0.31□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt0.31□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt0.31□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt0.31□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.31□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 YJL135WYJL135W 318 nt0.31□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt0.3□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 YGR025WYGR025W 303 nt0.3□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 RPL26BYGR034W 384 nt0.3□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 RPS24BYIL069C 408 nt0.29□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.29□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 YJR141WYJR141W 1044 nt0.28□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 UBC7YMR022W 498 nt0.28□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 snR13snR13 124 nt0.28□□□□□ -2.36
YDL085C-AQ3E7B7 PKH2YOL100W 3246 nt0.28□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 EFR3YMR212C 2349 nt0.27□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.27□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YCK3YER123W 1575 nt0.27□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 SBH1YER087C-B 249 nt0.26□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 BER1YLR412W 825 nt0.26□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 CDC33YOL139C 642 nt0.26□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 URM1YIL008W 300 nt0.25□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.25□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.25□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YOR218CYOR218C 420 nt0.25□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 SVS1YPL163C 783 nt0.25□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YPP1YGR198W 2454 nt0.25□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YDR029WYDR029W 315 nt0.24□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.24□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 BSC3YLR465C 309 nt0.24□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.24□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 Q0255Q0255 1419 nt0.23□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YDL016CYDL016C 303 nt0.23□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YDR133CYDR133C 336 nt0.23□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 BIG1YHR101C 1008 nt0.23□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.23□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YOL160WYOL160W 342 nt0.23□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 RPB10YOR210W 213 nt0.23□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 snR72snR72 98 nt0.22□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YBR064WYBR064W 429 nt0.22□□□□□ -2.37
YDL085C-AQ3E7B7 YPL044CYPL044C 549 nt0.21□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 SNU56YDR240C 1479 nt0.21□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 MCM10YIL150C 1716 nt0.21□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 RAD34YDR314C 2079 nt0.2□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 FYV10YIL097W 1551 nt0.2□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.2□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.2□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 UBX4YMR067C 1251 nt0.2□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 PAU12YGR294W 363 nt0.19□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.19□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 RPS27AYKL156W 249 nt0.19□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 YKL202WYKL202W 582 nt0.19□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 RPL26AYLR344W 384 nt0.19□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 TSC3YBR058C-A 243 nt0.19□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 YPL261CYPL261C 309 nt0.19□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 BEM3YPL115C 3387 nt0.19□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 EMC4YGL231C 573 nt0.18□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.18□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.18□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 TMA10YLR327C 261 nt0.17□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 YPL182CYPL182C 384 nt0.17□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 UTP20YBL004W 7482 nt0.17□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 PET111YMR257C 2403 nt0.16□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 OLI1Q0130 231 nt0.16□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt0.16□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 ASE1YOR058C 2658 nt0.16□□□□□ -2.38
YDL085C-AQ3E7B7 WIP1YDR374W-A 270 nt0.15□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 TIM13YGR181W 318 nt0.15□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 INP2YMR163C 2118 nt0.15□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.14□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.14□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 NFU1YKL040C 771 nt0.14□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 snR51snR51 107 nt0.14□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 ESP1YGR098C 4893 nt0.14□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 UBP3YER151C 2739 nt0.14□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.13□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 YBR206WYBR206W 324 nt0.13□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 TRS65YGR166W 1683 nt0.13□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.13□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 CUL3YGR003W 2235 nt0.12□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 YBL108WYBL108W 306 nt0.12□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 VIK1YPL253C 1944 nt0.12□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.12□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 YCR001WYCR001W 315 nt0.11□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 RTT102YGR275W 474 nt0.11□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 YLR269CYLR269C 351 nt0.11□□□□□ -2.39
YDL085C-AQ3E7B7 YAP6YDR259C 1152 nt0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.6 ms