Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC18A3Q16572 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A3Q16572 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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