Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NPTX1Q15818 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPTX1Q15818 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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