Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PDCD1Q15116 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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