Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
R3HDM1Q15032 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
R3HDM1Q15032 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
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