Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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COL19A1Q14993 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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COL19A1Q14993 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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COL19A1Q14993 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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COL19A1Q14993 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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COL19A1Q14993 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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COL19A1Q14993 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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COL19A1Q14993 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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COL19A1Q14993 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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COL19A1Q14993 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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COL19A1Q14993 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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COL19A1Q14993 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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COL19A1Q14993 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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COL19A1Q14993 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
COL19A1Q14993 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL19A1Q14993 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL19A1Q14993 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL19A1Q14993 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL19A1Q14993 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL19A1Q14993 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COL19A1Q14993 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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