Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SMCO1Q147U7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SMCO1Q147U7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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