Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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GBX1Q14549 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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GBX1Q14549 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GBX1Q14549 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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