Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBB3Q13509 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB3Q13509 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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