Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKRN4PQ13434 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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