Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEMA3FQ13275 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3FQ13275 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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