Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAF1Q13077 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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