Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ECH1Q13011 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ECH1Q13011 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms