Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 YML003WYML003W 873 nt1.62□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 PIG1YLR273C 1947 nt1.62□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 BIL1YOR304C-A 231 nt1.61□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.61□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 RFX1YLR176C 2436 nt1.6□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 YNL058CYNL058C 951 nt1.6□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 PAC1YOR269W 1485 nt1.6□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 YLL054CYLL054C 2532 nt1.6□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 SLX4YLR135W 2247 nt1.59□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 AZF1YOR113W 2745 nt1.59□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 CYC7YEL039C 342 nt1.59□□□□□ -2.15
RTP1Q12751 SGO1YOR073W 1773 nt1.59□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 PIK1YNL267W 3201 nt1.58□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.58□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 YLL032CYLL032C 2478 nt1.58□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 SLY1YDR189W 2001 nt1.57□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 PET127YOR017W 2403 nt1.57□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 SAS3YBL052C 2496 nt1.57□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.57□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.57□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 YBR174CYBR174C 315 nt1.57□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 NOC3YLR002C 1992 nt1.57□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 CCH1YGR217W 6120 nt1.57□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.56□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.56□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 SEC21YNL287W 2808 nt1.56□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 VPS54YDR027C 2670 nt1.55□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 APL2YKL135C 2181 nt1.55□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 YDL211CYDL211C 1119 nt1.55□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 RPS20YHL015W 366 nt1.55□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 MRPL31YKL138C 396 nt1.55□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 UPS1YLR193C 528 nt1.55□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.55□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 RPB10YOR210W 213 nt1.55□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 LAA1YJL207C 6045 nt1.54□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 NUT2YPR168W 474 nt1.54□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.53□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 YSY6YBR162W-A 198 nt1.53□□□□□ -2.16
RTP1Q12751 IML1YJR138W 4755 nt1.52□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.52□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.52□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 SDH2YLL041C 801 nt1.52□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 MSN5YDR335W 3675 nt1.52□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 NUT1YGL151W 3399 nt1.51□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 ENV11YGR071C 2583 nt1.51□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.51□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 snR14snR14 160 nt1.51□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 snR51snR51 107 nt1.51□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 FYV8YGR196C 2454 nt1.5□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 MUK1YPL070W 1839 nt1.5□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 CSN9YDR179C 489 nt1.5□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 YAF9YNL107W 681 nt1.5□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.5□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 NUP188YML103C 4968 nt1.5□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 TRM732YMR259C 4263 nt1.49□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 COG4YPR105C 2586 nt1.49□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 RRT15YLR162W-A 189 nt1.49□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 YPL225WYPL225W 441 nt1.49□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 SCW11YGL028C 1629 nt1.48□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 RSM22YKL155C 1887 nt1.48□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 YDR426CYDR426C 378 nt1.48□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 YJL135WYJL135W 318 nt1.48□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 YLL020CYLL020C 306 nt1.48□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.48□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 SPT21YMR179W 2277 nt1.47□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 YPR063CYPR063C 423 nt1.47□□□□□ -2.17
RTP1Q12751 YKL136WYKL136W 399 nt1.46□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 SWI4YER111C 3282 nt1.46□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 MPT5YGL178W 2580 nt1.45□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 snR72snR72 98 nt1.45□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 RPL35AYDL191W 363 nt1.45□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 RIM20YOR275C 1986 nt1.45□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 AIM44YPL158C 2277 nt1.44□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.44□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 ZIP2YGL249W 2115 nt1.44□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 PAU12YGR294W 363 nt1.44□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 YJR011CYJR011C 786 nt1.44□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 PCC1YKR095W-A 267 nt1.44□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 HTB2YBL002W 396 nt1.44□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 INP2YMR163C 2118 nt1.44□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 snR36snR36 182 nt1.44□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 PAU24YBR301W 363 nt1.44□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 TTI1YKL033W 3117 nt1.44□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 NPC2YDL046W 522 nt1.43□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.43□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.43□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 CLU1YMR012W 3834 nt1.42□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 CDC25YLR310C 4770 nt1.42□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 YDR102CYDR102C 333 nt1.42□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.42□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.42□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.42□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 YKL118WYKL118W 312 nt1.42□□□□□ -2.18
RTP1Q12751 RPL38YLR325C 237 nt1.42□□□□□ -2.18
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