Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 NIP100YPL174C 2607 nt1.26□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 snR72snR72 98 nt1.26□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 GIM4YEL003W 336 nt1.26□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 YAR053WYAR053W 297 nt1.26□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 YOR199WYOR199W 330 nt1.26□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 snR14snR14 160 nt1.26□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 SMC4YLR086W 4257 nt1.26□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 AHC1YOR023C 1701 nt1.26□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 UFD2YDL190C 2886 nt1.26□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 FRK1YPL141C 2598 nt1.25□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 YGL217CYGL217C 342 nt1.25□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 ANS1YHR126C 480 nt1.25□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 YJL135WYJL135W 318 nt1.25□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.25□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 NUP192YJL039C 5052 nt1.25□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 YLR422WYLR422W 5799 nt1.25□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 RAD9YDR217C 3930 nt1.24□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 BST1YFL025C 3090 nt1.24□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 MUK1YPL070W 1839 nt1.24□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.24□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 SDH2YLL041C 801 nt1.24□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 YLR140WYLR140W 327 nt1.24□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 RPL38YLR325C 237 nt1.24□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.23□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 RSM22YKL155C 1887 nt1.23□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 NCA2YPR155C 1851 nt1.23□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.23□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.23□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 NUP188YML103C 4968 nt1.23□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 SLX4YLR135W 2247 nt1.22□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 DCP2YNL118C 2913 nt1.22□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.22□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 YOL160WYOL160W 342 nt1.22□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 CDC25YLR310C 4770 nt1.22□□□□□ -2.21
HMS1Q12398 RAD50YNL250W 3939 nt1.21□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 RPL35AYDL191W 363 nt1.21□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YDR426CYDR426C 378 nt1.21□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.21□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YNL058CYNL058C 951 nt1.21□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YOR029WYOR029W 336 nt1.21□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 TIM18YOR297C 579 nt1.21□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YSY6YBR162W-A 198 nt1.21□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 SPC98YNL126W 2541 nt1.21□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 INP2YMR163C 2118 nt1.21□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 CDC39YCR093W 6327 nt1.21□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 EST2YLR318W 2655 nt1.2□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.2□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YOR376WYOR376W 369 nt1.2□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.2□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 SLY1YDR189W 2001 nt1.19□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.19□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 RPB10YOR210W 213 nt1.19□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YPL225WYPL225W 441 nt1.19□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 MPT5YGL178W 2580 nt1.19□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 ALY2YJL084C 3141 nt1.19□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 SLD3YGL113W 2007 nt1.18□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 ZIP2YGL249W 2115 nt1.18□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.18□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YAF9YNL107W 681 nt1.18□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 NOC3YLR002C 1992 nt1.17□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 RAD34YDR314C 2079 nt1.17□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 VPS54YDR027C 2670 nt1.17□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 MAD1YGL086W 2250 nt1.17□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.17□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.17□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.17□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.17□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.17□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.17□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.17□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YPR197CYPR197C 564 nt1.17□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 APL3YBL037W 3078 nt1.17□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 SAS3YBL052C 2496 nt1.16□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 MSN5YDR335W 3675 nt1.16□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 SCW11YGL028C 1629 nt1.16□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 NPC2YDL046W 522 nt1.16□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YDL211CYDL211C 1119 nt1.16□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YDR102CYDR102C 333 nt1.16□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.16□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 YJR011CYJR011C 786 nt1.16□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 BIL1YOR304C-A 231 nt1.16□□□□□ -2.22
HMS1Q12398 ATP6Q0085 780 nt1.15□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 RIM20YOR275C 1986 nt1.15□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 SWI4YER111C 3282 nt1.15□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 SPO75YLL005C 2607 nt1.13□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 MAM33YIL070C 801 nt1.13□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 STB6YKL072W 2301 nt1.12□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 COG4YPR105C 2586 nt1.12□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 APL1YJR005W 2103 nt1.12□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 EAF1YDR359C 2949 nt1.12□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 HTB2YBL002W 396 nt1.12□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.12□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 LCD1YDR499W 2244 nt1.12□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 SET3YKR029C 2256 nt1.12□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 SPT21YMR179W 2277 nt1.12□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 PCC1YKR095W-A 267 nt1.11□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.11□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 RPL33BYOR234C 324 nt1.11□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 IFH1YLR223C 3258 nt1.11□□□□□ -2.23
HMS1Q12398 SEC5YDR166C 2916 nt1.1□□□□□ -2.23
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