Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 SVL3YPL032C 2478 nt2.22□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 PAU8YAL068C 363 nt2.22□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 PAU18YLL064C 363 nt2.22□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 RPS29AYLR388W 171 nt2.22□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 PAU6YNR076W 363 nt2.22□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 PAU20YOL161C 363 nt2.22□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.22□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 EDS1YBR033W 2760 nt2.22□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 AIM44YPL158C 2277 nt2.21□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 FAR11YNL127W 2862 nt2.21□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 ZIP2YGL249W 2115 nt2.21□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 DBP10YDL031W 2988 nt2.21□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 PIG1YLR273C 1947 nt2.21□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.2□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YLR012CYLR012C 300 nt2.2□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.2□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YOR055WYOR055W 435 nt2.2□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.2□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 COY1YKL179C 2040 nt2.2□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 KRE33YNL132W 3171 nt2.2□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 SBE22YHR103W 2559 nt2.19□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YDL196WYDL196W 330 nt2.19□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.19□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.19□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YCL046WYCL046W 324 nt2.19□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 FIG4YNL325C 2640 nt2.19□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 PIP2YOR363C 2991 nt2.18□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.18□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.18□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt2.18□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YJL120WYJL120W 324 nt2.18□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt2.18□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YEF3YLR249W 3135 nt2.17□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 NUP100YKL068W 2880 nt2.17□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 ATP7YKL016C 525 nt2.17□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 TOF1YNL273W 3717 nt2.17□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 TRS130YMR218C 3309 nt2.17□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 MAK10YEL053C 2202 nt2.17□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 RAD34YDR314C 2079 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 PTP2YOR208W 2253 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 NOP14YDL148C 2433 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YOL098CYOL098C 3114 nt2.15□□□□□ -2.06
TRM13Q12383 YOR102WYOR102W 351 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 MAD1YGL086W 2250 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 BRP1YGL007W 378 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 NEW1YPL226W 3591 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 IRA2YOL081W 9240 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 PBY1YBR094W 2262 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 NOC3YLR002C 1992 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 YJL022WYJL022W 309 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 SLD3YGL113W 2007 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 RSE1YML049C 4086 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 NAM7YMR080C 2916 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 BNI1YNL271C 5862 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 TUS1YLR425W 3924 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 YBL109WYBL109W 336 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 DGR2YKL121W 2559 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 UBR1YGR184C 5853 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 HAL9YOL089C 3093 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 STE11YLR362W 2154 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 PAU3YCR104W 375 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 SCD5YOR329C 2619 nt2.1□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 BUD2YKL092C 3315 nt2.1□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 SEC16YPL085W 6588 nt2.1□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 PDR11YIL013C 4236 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 SSD1YDR293C 3753 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 MLH3YPL164C 2148 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 AHC1YOR023C 1701 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 VPS8YAL002W 3825 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 RPS17AYML024W 411 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM13Q12383 FKS3YMR306W 5358 nt2.09□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 APL2YKL135C 2181 nt2.09□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 HMI1YOL095C 2121 nt2.08□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 RPL31AYDL075W 342 nt2.08□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.08□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 YMR326CYMR326C 309 nt2.08□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 GIP3YPL137C 3831 nt2.08□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 HSH155YMR288W 2916 nt2.08□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 CAT2YML042W 2013 nt2.08□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 MET18YIL128W 3099 nt2.08□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 RAV1YJR033C 4074 nt2.07□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 PET309YLR067C 2898 nt2.07□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 TIM9YEL020W-A 264 nt2.07□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 PHO91YNR013C 2685 nt2.06□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 CDC60YPL160W 3273 nt2.06□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 IRC8YJL051W 2469 nt2.06□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.06□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 SAP190YKR028W 3102 nt2.05□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 SGS1YMR190C 4344 nt2.05□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 UBP15YMR304W 3693 nt2.05□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 ENV11YGR071C 2583 nt2.05□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 USO1YDL058W 5373 nt2.04□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 TFB5YDR079C-A 219 nt2.04□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 YDR544CYDR544C 429 nt2.04□□□□□ -2.08
TRM13Q12383 IRE1YHR079C 3348 nt2.04□□□□□ -2.08
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