Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 MGM1YOR211C 2646 nt3.3□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 RGR1YLR071C 3249 nt3.3□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 VPS16YPL045W 2397 nt3.3□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 YMR317WYMR317W 3423 nt3.29□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 STB6YKL072W 2301 nt3.28□□□□□ -1.88
YRR1Q12172 UTP8YGR128C 2142 nt3.28□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 SNC1YAL030W 354 nt3.27□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 SQS1YNL224C 2304 nt3.26□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 RSE1YML049C 4086 nt3.26□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt3.26□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 RPS22AYJL190C 393 nt3.26□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 DGR2YKL121W 2559 nt3.26□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 APL2YKL135C 2181 nt3.25□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 YLL020CYLL020C 306 nt3.25□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 BMS1YPL217C 3552 nt3.25□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 CDC53YDL132W 2448 nt3.24□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 TFC4YGR047C 3078 nt3.23□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 STT4YLR305C 5703 nt3.23□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 FLO9YAL063C 3969 nt3.23□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 SDC25YLL016W 3147 nt3.23□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 YDR521WYDR521W 336 nt3.23□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 ACB1YGR037C 264 nt3.23□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 snR39BsnR39B 96 nt3.23□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 VTC3YPL019C 2508 nt3.23□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 GCV2YMR189W 3105 nt3.22□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 PHO91YNR013C 2685 nt3.22□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.22□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 HMI1YOL095C 2121 nt3.22□□□□□ -1.89
YRR1Q12172 LHS1YKL073W 2646 nt3.21□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 APL1YJR005W 2103 nt3.21□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 PDR8YLR266C 2106 nt3.21□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 YNL266WYNL266W 420 nt3.21□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 VMR1YHL035C 4779 nt3.2□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 SAP190YKR028W 3102 nt3.2□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 NOP14YDL148C 2433 nt3.2□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 ALK1YGL021W 2283 nt3.19□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 SPO14YKR031C 5052 nt3.19□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt3.19□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt3.19□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 POL2YNL262W 6669 nt3.19□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 SRO77YBL106C 3033 nt3.19□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 DCP2YNL118C 2913 nt3.18□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 MET6YER091C 2304 nt3.18□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 NEW1YPL226W 3591 nt3.18□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 ROM1YGR070W 3468 nt3.18□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 YJR039WYJR039W 3366 nt3.18□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 MLH1YMR167W 2310 nt3.18□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt3.17□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt3.17□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 ECM21YBL101C 3354 nt3.17□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 RIF1YBR275C 5751 nt3.17□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 YSP2YDR326C 4317 nt3.17□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 BUD4YJR092W 4344 nt3.17□□□□□ -1.9
YRR1Q12172 RPS28BYLR264W 204 nt3.15□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 FIR1YER032W 2631 nt3.15□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 UBP15YMR304W 3693 nt3.14□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 RGC1YPR115W 3252 nt3.14□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 TOR1YJR066W 7413 nt3.14□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 SAP185YJL098W 3177 nt3.14□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt3.14□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 FLO5YHR211W 3228 nt3.14□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 SWR1YDR334W 4545 nt3.13□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 snR53snR53 91 nt3.13□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 COG6YNL041C 2520 nt3.12□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 BFR2YDR299W 1605 nt3.11□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 RPA190YOR341W 4995 nt3.11□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 NMD2YHR077C 3270 nt3.11□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 RPL37BYDR500C 267 nt3.1□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt3.1□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt3.1□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 SSN2YDR443C 4263 nt3.1□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 TUS1YLR425W 3924 nt3.09□□□□□ -1.91
YRR1Q12172 CSR2YPR030W 3366 nt3.09□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 UBP1YDL122W 2430 nt3.09□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 YPL150WYPL150W 2706 nt3.08□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 VPS8YAL002W 3825 nt3.08□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 MAK10YEL053C 2202 nt3.08□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt3.08□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 BIR1YJR089W 2865 nt3.08□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 BUB1YGR188C 3066 nt3.07□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 SCP160YJL080C 3669 nt3.07□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 CBF2YGR140W 2871 nt3.07□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 INP51YIL002C 2841 nt3.06□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 YGR067CYGR067C 2415 nt3.06□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 FLO1YAR050W 4614 nt3.06□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 MLH3YPL164C 2148 nt3.05□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 MDM1YML104C 3384 nt3.05□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 POL3YDL102W 3294 nt3.05□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 KAP120YPL125W 3099 nt3.05□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 EAF1YDR359C 2949 nt3.05□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 snR70snR70 164 nt3.05□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt3.05□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt3.04□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt3.04□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 PKH2YOL100W 3246 nt3.04□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt3.03□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt3.03□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 PMR1YGL167C 2853 nt3.03□□□□□ -1.92
YRR1Q12172 DRS2YAL026C 4068 nt3.03□□□□□ -1.93
YRR1Q12172 COG4YPR105C 2586 nt3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.1 ms