Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIK1Q12045 YLR434CYLR434C 384 nt1.08□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YML003WYML003W 873 nt1.08□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 RPL9BYNL067W 576 nt1.08□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 EFR3YMR212C 2349 nt1.07□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 AIM9YER080W 1884 nt1.07□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YKL063CYKL063C 504 nt1.07□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YAR047CYAR047C 321 nt1.07□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 UPS1YLR193C 528 nt1.07□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 ISF1YMR081C 1017 nt1.07□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YPL185WYPL185W 396 nt1.07□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YPR063CYPR063C 423 nt1.07□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 CDC39YCR093W 6327 nt1.07□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 NOC3YLR002C 1992 nt1.07□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YER079WYER079W 633 nt1.06□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YHL041WYHL041W 450 nt1.06□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YKL202WYKL202W 582 nt1.06□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 SCC2YDR180W 4482 nt1.06□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 SWI4YER111C 3282 nt1.06□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 APL3YBL037W 3078 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YKL083WYKL083W 615 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YNL324WYNL324W 396 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YPL229WYPL229W 621 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 DOP1YDR141C 5097 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 PCF11YDR228C 1881 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 SEC3YER008C 4011 nt1.05□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 SPT21YMR179W 2277 nt1.04□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YLL020CYLL020C 306 nt1.04□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 SCW11YGL028C 1629 nt1.04□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 BEM2YER155C 6504 nt1.03□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 EAF1YDR359C 2949 nt1.03□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 SAS3YBL052C 2496 nt1.03□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 AGA2YGL032C 264 nt1.03□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.03□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 PIP2YOR363C 2991 nt1.03□□□□□ -2.24
VIK1Q12045 SLY1YDR189W 2001 nt1.03□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 SLD3YGL113W 2007 nt1.03□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 STB6YKL072W 2301 nt1.03□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 SWF1YDR126W 1011 nt1.02□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 YGR042WYGR042W 816 nt1.02□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 YLL054CYLL054C 2532 nt1.02□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt1.02□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 snR51snR51 107 nt1.02□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 MPT5YGL178W 2580 nt1.01□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 snR72snR72 98 nt1.01□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 SIP4YJL089W 2490 nt1.01□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 ALY2YJL084C 3141 nt1□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 ZIP2YGL249W 2115 nt1□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 NPC2YDL046W 522 nt1□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 YJL135WYJL135W 318 nt1□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 RRT1YBL048W 312 nt1□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 YOR199WYOR199W 330 nt1□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 SET3YKR029C 2256 nt1□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 YHR138CYHR138C 345 nt0.99□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.99□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.99□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 YOL160WYOL160W 342 nt0.99□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 RPB10YOR210W 213 nt0.99□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 LEE1YPL054W 906 nt0.99□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 YBR285WYBR285W 435 nt0.99□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 YJR003CYJR003C 1560 nt0.99□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 PAC1YOR269W 1485 nt0.99□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 IFH1YLR223C 3258 nt0.98□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 YBR012CYBR012C 420 nt0.98□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.98□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 LCD1YDR499W 2244 nt0.98□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 SMC1YFL008W 3678 nt0.97□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.97□□□□□ -2.25
VIK1Q12045 KAP120YPL125W 3099 nt0.96□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 VAR1Q0140 1197 nt0.96□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 BSC3YLR465C 309 nt0.96□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 STO1YMR125W 2586 nt0.96□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 COG4YPR105C 2586 nt0.96□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 NUP145YGL092W 3954 nt0.95□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 SLI15YBR156C 2097 nt0.95□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 ATG31YDR022C 591 nt0.95□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 RPS20YHL015W 366 nt0.95□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.95□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 YPL261CYPL261C 309 nt0.95□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 FIG4YNL325C 2640 nt0.94□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 INP2YMR163C 2118 nt0.94□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 RAD34YDR314C 2079 nt0.94□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.94□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 ANS1YHR126C 480 nt0.94□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.94□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 YNL058CYNL058C 951 nt0.94□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 YOR053WYOR053W 342 nt0.94□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 IML1YJR138W 4755 nt0.94□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 NIP100YPL174C 2607 nt0.94□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.93□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.93□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.93□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.92□□□□□ -2.26
VIK1Q12045 NUP157YER105C 4176 nt0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.7 ms