Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PUDPQ08623 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PUDPQ08623 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms