Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CYP4F3Q08477 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYP4F3Q08477 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms