Protein–RNA interactions for Protein: Q07879

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, yeastyeast

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG10Q07879 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.35□□□□□ -2.35
ATG10Q07879 SVS1YPL163C 783 nt0.35□□□□□ -2.35
ATG10Q07879 BFR2YDR299W 1605 nt0.35□□□□□ -2.35
ATG10Q07879 snR9snR9 187 nt0.34□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.34□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 PPN1YDR452W 2025 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 SLI15YBR156C 2097 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 ISD11YER048W-A 285 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 MND1YGL183C 660 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 MRPL31YKL138C 396 nt0.33□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 YCR100CYCR100C 951 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 YGR290WYGR290W 444 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 GMC2YLR445W 567 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 YBR063CYBR063C 1215 nt0.32□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 NPC2YDL046W 522 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 RPL32YBL092W 393 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 BIR1YJR089W 2865 nt0.31□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 MPC1YGL080W 393 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 SCEIQ0160 708 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 RFX1YLR176C 2436 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 PAN2YGL094C 3348 nt0.3□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 IQG1YPL242C 4488 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 CHS6YJL099W 2241 nt0.29□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 YOR248WYOR248W 303 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 AFR1YDR085C 1863 nt0.28□□□□□ -2.36
ATG10Q07879 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.27□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 YLR252WYLR252W 306 nt0.27□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 NPR2YEL062W 1848 nt0.27□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 YDL187CYDL187C 330 nt0.26□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 RPL9AYGL147C 576 nt0.26□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.26□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 ECM9YKR004C 1134 nt0.26□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 AFB1YLR040C 675 nt0.26□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 YOR282WYOR282W 321 nt0.26□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 SPO11YHL022C 1197 nt0.25□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 RPS24BYIL069C 408 nt0.25□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 YJR087WYJR087W 351 nt0.25□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 YPR039WYPR039W 336 nt0.25□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 MYO1YHR023W 5787 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 PMP1YCR024C-A 123 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 YDR344CYDR344C 444 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 GPG1YGL121C 381 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 RPL26BYGR034W 384 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 ILM1YJR118C 612 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 YAL066WYAL066W 309 nt0.24□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 ZIP2YGL249W 2115 nt0.23□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 YDR269CYDR269C 324 nt0.23□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 ABF2YMR072W 552 nt0.23□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 LOA1YPR139C 903 nt0.23□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 NOP9YJL010C 2001 nt0.23□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 RCN2YOR220W 798 nt0.22□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 IRC16YPR038W 360 nt0.22□□□□□ -2.37
ATG10Q07879 SBH1YER087C-B 249 nt0.21□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 YHL042WYHL042W 453 nt0.21□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 BUL2YML111W 2763 nt0.2□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.2□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 CDC33YOL139C 642 nt0.2□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 UTP8YGR128C 2142 nt0.2□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 YSP1YHR155W 3687 nt0.19□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.19□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 PKH2YOL100W 3246 nt0.19□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 BEM3YPL115C 3387 nt0.19□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 YER135CYER135C 393 nt0.18□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 YGL239CYGL239C 315 nt0.18□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 APQ13YJL075C 417 nt0.17□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 YJL135WYJL135W 318 nt0.17□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.17□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 IPP1YBR011C 864 nt0.17□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 EFR3YMR212C 2349 nt0.16□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.16□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 HUR1YGL168W 333 nt0.16□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 BSC3YLR465C 309 nt0.16□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.16□□□□□ -2.38
ATG10Q07879 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 SEM1YDR363W-A 270 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YIL029CYIL029C 429 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YOL029CYOL029C 606 nt0.15□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 RPL26AYLR344W 384 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 RPB10YOR210W 213 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.14□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 PET111YMR257C 2403 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YKL044WYKL044W 321 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YPL044CYPL044C 549 nt0.13□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 PRP21YJL203W 843 nt0.12□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YNL050CYNL050C 813 nt0.12□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YGR025WYGR025W 303 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 GRX5YPL059W 453 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YBR064WYBR064W 429 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 FYV10YIL097W 1551 nt0.11□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 MCM10YIL150C 1716 nt0.1□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 snR72snR72 98 nt0.1□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YDR029WYDR029W 315 nt0.1□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 VMA21YGR105W 234 nt0.1□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 BIG1YHR101C 1008 nt0.1□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.1□□□□□ -2.39
ATG10Q07879 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.8 ms