Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EGR3Q06889 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EGR3Q06889 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms